Oui, au-delà de la marge d'erreur du constructeur, le GPS mesure le déplacement sur la géosphère théorique, sans tenir compte des dénivelés comme le fait le véhicule en mesurant la fréquence de rotation. Il est donc normal d'avoir des variations.

Alors il y a sans doute un problème de traitement dans la fréquence de rotation. La circonférence de la roue doit être erronée. C'est un problème de codage ou d'adaptation dans un des calculateurs ABS, bloc instrument... Je l'ai vu il y a longtemps mais comme je n'avais pas de problème, je n'ai pas mémorisé. J'avais un problème du même style au niveau du signal de la jauge à carburant (mauvais traitement du signal et erreur dans le calcul de l'autonomie), 5 passages en concession sans aucun résultat puisque l'erreur de codage était présente sur le véhicule à sa sortie d'usine, ils se contentaient de comparer le codage d'origine forcément identique.
Va faire un tour sur le forum RossTech, il me semble que le sujet a été traité.

Petite précision: y aurait-il eu une mise à jour du calculateur du bloc instrument?
Lors de la MàJ d'un calculateur, le firmware peut modifier les références liées au codage donc le codage d'origine ne garantit plus le fonctionnement normal.